在教杨过修练武功之余，本着德智体全面发展的需要，小龙女又给杨过当起了老师，给他上课。原著里杨过在桃花岛上曾经跟着黄蓉学了“论语”“孟子”等若干书籍，但现在小龙女提前把杨过带到了古墓，杨过就没机会跟黄蓉读书了，于是这教书的重担自然也落到了小龙女身上了。古墓里也有很多书，但小龙女却不愿意全按照这上面的内容把杨过教成个书呆子，更多得是按照自己前世里学习的内容教杨过：不但按语文课程教杨过读书识字、阅读作文，也教杨过各种数学知识、代数几何，更加教杨过天文地理、历史人文，甚至还教他一些简单易懂的物理常识。另外为了将来学习凌波微步的需要，小龙女还特意传授杨过易经八卦之术；但这却是一门极其深奥的学问，非短时间可以学完，小龙女也是自己看道家书籍加上请教师傅花了几年才搞懂，因此也嘱咐杨过慢慢学习、仔细研究。于是上午修练内功，下午习练招式，晚上上课读书便成了杨过的全部生活。
杨过毕竟是小孩子，天天这样按部就班的学习练功，时间长了不禁有些按耐不住寂寞了。本着劳逸结合的原则，小龙女偶然会教杨过弹琴、唱歌，帮助他放松身心、调节情绪。不过杨过最喜欢的是听小龙女讲故事。原因是小龙女希望杨过成为一个明事理、分善恶的人，不希望他再有原著里不辩是非、冲动易怒性格，因此经常给他讲历史故事、评辩人物优劣。但是历史本身毕竟是很枯燥乏味的，为了引起杨过的兴趣，小龙女就开始给他讲有关历史的章回小说，于是从“封神演义”“三国演义”“隋唐演义”“西游记”一直讲到本朝的“杨家将”“水浒传”和“岳飞传”等，杨过听得津津有味，每天都缠着小龙女不放；小龙女则每天以“欲知后事如何，请听明天分解”为终结。于是小龙女的生活中便又多了项讲故事的任务了。
当杨过练成‘天罗地网势’掌法之后，小龙女便将古墓派的内功所传，拳法掌法，兵刃暗器，一项项的传授。如此只过得一年半，杨过已尽得所传，藉着寒玉床之助，进境奇速。古墓派武功创自女子，师徒三代又是女人，不免柔灵有余，沉厚不足。但杨过生性浮躁轻动，这武功的路子倒也合于他的本性，况且他两年时间已经修练完了九阳神功前三卷，功力日渐深厚，有效得克服了古墓派武功的缺点，并已经开始修练九阳神功第四卷功夫。小龙女这两年下来依旧没有把九阳神功第四卷完成，只是完成了大半，估计还要一年便可结束。不过全真派的武功招式和**上的武功剑法小龙女倒是全部都练成了，只是没有练过**的内功，多少有些形似而神非。后来再有时间小龙女便练习玉箫剑法、弹指神通、白虹掌力以及其他从贺兰山石洞里学来的功夫。虽然小无相功不能练了，但自身的九阳神功日渐深厚，也足以催动使用这些功夫。
从第三年起，小龙女先后传授杨过全真派武功和**上的功夫，等到一年之后杨过基本练成之后，小龙女的四卷九阳神功也尽数练成。于是小龙女便在一间石室里挂上两层布帘，上面均留下两个孔洞，自己和杨过分别坐在布帘两侧，各自解下衣衫后将手从布帘上的孔洞穿过，两人手掌在两层布帘的中间相抵；小龙女将修习**的口诀法门说了一段，杨过问明白了其中疑难不解之处，两人便开始合作练功。只要谁在练功时遇到难处，对方受到感应，立时能运功为助。想来两人的九阳神功皆较为深厚，因此修练**内功却是得心应手，只不到三个月功夫，两人便都将**的内功尽数练到了九段。练成之后，杨过颇为开心，觉得自己将古墓派最高深的武功练成了；而小龙女却暗自叹息，知道古墓派的内功心法与九阳神功相比还是差距极大，可想而知少林寺武功确实博大精深，既非古墓派可以相比，亦非全真派能够比拟。
想到了少林寺武功，小龙女才想起自己手里还有一部易筋经可以修练，便嘱咐杨过继续修练九阳神功第四层，同时把王重阳留在石壁上的九阴真经中的武功招式、诀窍奥妙尽数教给杨过，让他自行修练。只是担心与杨过现在修练的九阳神功冲突，因此小龙女未将九阴真经中的易筋锻骨篇内功心法教给杨过，打算等杨过将九阳神功尽数练完了之后再传授给他。小龙女这些年主修九阳神功，但易筋锻骨篇也一直没放下，每天夜里都保持一定时间的运转修练，只是因为以前已经练过四年，因此不如九阳神功般修练得这么勤了。
打发完杨过之后，小龙女便开始自行修练易筋经。小龙女自将寒玉床让给杨过后，初时仍与他同室而卧，过了年余，才搬入隔壁石室。现在正好独自修练易筋经，不再受杨过影响。小龙女打开易筋经，放入水中侵湿，小心翼翼的翻动，惟恐弄破了书页，见书页上的弯弯曲曲之间，果然出现一个僧人的图形。这僧人姿式极是奇特，脑袋从胯下穿过，伸了出来，双手抓着两只脚。只见他身旁写着两个极大的黄字，弯弯曲曲的形伏诡异，笔划中却有许多极小的红色箭头。那些小箭头，自喉头而胸腹，绕了几个弯，自双肩而头顶，这才消失。小龙女依次翻页，果然见到每一页上都显出一个怪僧的图形，姿式各不相同。小龙女便照第一页中图形，依式而为，更依循怪字中的红色小箭头心中存想，隐隐觉得有一条极为为阳罡的热线，在四肢百骸中行走。热线每爬行一会，小龙女全身便说不出的舒服畅快。书中裸僧姿势甚多，怪字中的小箭头也是般旋曲折，变化繁复。小龙女依循不同姿式控制热线，体内急凉急暖，各有不同的舒泰。
如此修练两年之后，小龙女便将易筋经上所有僧人图形的动作和箭头指示尽数修练完成。其中在练了一年之后，杨过又来找了小龙女，说是已经把九阴真经的武功招式尽数练完了。于是小龙女又传了他弹指神通和玉萧剑法，再嘱咐他好好修练义父教的蛤蟆功；因为小龙女自己没什么凌厉的掌法教给杨过，所以希望杨过自己能把刚猛的蛤蟆功练好了。待两年过后，这一日小龙女合上易筋经，想到自己已经专心致至得修练了两年易筋经，莫不要将九阳神功荒废了。于是再运行了一遍九阳神功，竟然吃惊得发现自身体内的九阳真气居然比原先修练易筋经之前增长了一倍不止。直到这时，小龙女才明白，之前自己在修练易筋经的时候体内的热气便是九阳真气，实际上是使用易筋经的经脉运行路线来运行九阳真气，却是在无意之中将九阳神功和易筋经两门上乘内功加以融合、合二为一了。今后只要修习易筋内功，九阳神功便能够自动得以增长。明白了这一结果，让小龙女又惊又喜，知道自己找到了一举两得的练功法门。其实易筋本身固然是最上乘的内功心法，而且还具有将体内真气融汇贯通的效果。早在天龙八部中游坦之便用易筋经来修练冰蚕寒气，最终练成了冰蚕寒掌；而在笑傲江湖中令狐冲身上具备了数十种不同的真气，最后也是靠易筋经来融合的。
此时两人在古墓之中已待了五年，杨过的四卷九阳神功也已练完。小龙女便与杨过配合，修练起**中最后一章的玉女素心剑法。可以说这才是林朝英留下来最精深的武功，自然是要详加练习。当年古墓派祖师林朝英独居古墓而创下**，虽是要克制全真派武功，但对王重阳始终情意不减，写到最后一章之时，幻想终有一日能与意中人并肩击敌，因之这一章的武术是一个使**，一个使全真功夫，相互应援，分进合击。林朝英当日柔肠百转，深情无限，缠绵相思，尽数寄托于这章武经之中。双剑纵横是宾，携手克敌才是主旨所在。当小龙女使玉女剑法之时，杨过便使全真剑法配合，反之亦然。只可惜两人毕竟还不是情侣，虽然小龙女对杨过有情，但杨过年纪幼小、懵懵懂懂，根本无法领悟，小龙女出于矜持又不好意思主动向杨过表达示爱，因此两人虽然练成了剑法招式，却无法做到心意相连、相互间心灵不能沟通，所以许多精妙之处实在难以领会。
小龙女知道这样修练玉女素心剑法也无法提高，便暂时作罢。于是小龙女将凌波微步的步法尽数告诉了杨过，并亲自试演走给他看。杨过之前已经在小龙女的指导下，自行钻研学习了易经四五年，如今再有小龙女的详加指教，因此只花了半个月便将凌波微步学会。于是小龙女便让杨过再自行修练、逐步提高。