开第一炮的是汉军，看到荷兰人巨大的战舰开了过来，汉军士兵们本能的产生了一种恐惧感，便开了第一炮。
刹那间江面上炮声隆隆，一场大海战就在台江及其附近海面上展开了。荷兰两艘巨舰舰大炮多，向汉军展开了猛轰，炮弹在水面上激起了条条巨大的水柱。一些汉军船只被炮弹击中，刹那间四分五裂。汉军也展开了猛烈的还击，他们利用自己船多的优势，往往集中上百艘船的火力猛攻荷兰的一只船，双拳难敌四手，荷兰的两艘小艇和十几艘帆船不大一会儿工夫就在汉军的围攻中沉没。一艘通讯舰一看情况不妙，立即向巴达维亚方向逃去。荷兰的两艘巡洋舰赫克托号和玛利亚号的日子也很不好过，汉军猛烈的炮火使它们渐渐招架不住，赫克托号在汉军新式火炮的准确轰击下，甲板上的炮基本被炸干净了，到处起火，汉军又把大炮当成平射炮使用，把赫克托号的右舷炸开了一个大口子，其他船上的汉军一看，都得到了启发，汉军的船小，当平射炮用正好可以击中船舷，也纷纷把大炮当成平射炮用。
在炮弹的撕扯下，赫克托号坚持不住了，渐渐沉入了水中。另一艘巡洋舰玛利亚号一看情况不妙，连忙拖着冒烟的船体向台湾城下逃去，想借台湾城的火炮保护自己。
汉军没有让他们如意，看看他们要跑，击沉了其他小船的汉军船只，或者是刚刚把赫克托号击沉的汉军都把注意力放到了这块“肥肉”上了，数百艘船不管自己的射程够不够，只要估摸着不会炸了自己人，都一起开了炮，岸上的汉军炮兵也来凑热闹，雨点般的炮弹砸向玛利亚号，无数的水柱被激起，场面煞是壮观，倒霉的玛利亚号没有了圣母的保佑，被七十多枚炮弹给击中了，迅速解体，沉入了冰冷的海水中。
至此，荷兰的台湾海军全军覆没，除了一艘通讯舰外，全都被击沉了，落水的荷兰士兵被俘虏了十几个，俘虏这么少的原因是一些汉军士兵浑水摸鱼，把荷兰落水的士兵给宰了不少。
那艘逃了的通讯舰一口气逃了很远，一看没有人追来，荷兰士兵们纷纷舒了口气，以为拣了一条命。舰长不停的划着十字，感谢上帝的保佑。突然身边的士兵急急的摇晃着他：“中尉，你看！”
舰长一看，顿时脸都绿了：前方海面上密密麻麻的布满了中国人的战船。他一下子瘫坐到了地上，用颤抖的声音说：“降帆，升白旗，投降！”
拦住他们的是施琅的舰队。
台湾岛上，汉军在包围了荷兰人的城堡后，并没有急着进攻，而是构筑工事，架设大炮，调调大炮，休息休息。
郑芝龙的意图是各个击破，尽量减少伤亡。对于两个主要城堡之一的赤嵌楼，虽然建筑的非常坚固，但是致命的缺陷是城里没有水源，饮水是从城外高山上引来的。郑芝龙一包围赤嵌楼，就按照何廷斌的建议，派人把赤嵌的水源给截断了，然后就把赤嵌撂在一边不管了。
主要的注意力是在台湾城的身上，台湾城城固炮利，外围还有一个乌特利支堡支撑着，攻取难度比较大。要攻克台湾，首先就得把它外围的支撑点乌特利支堡给收拾掉。怎么攻呢？郑芝龙首先想到的是大炮。
汉军自从在武昌和九江会战中，利用大炮取得骄人的成绩以来，非常重视对大炮的运用。陆军军官学院第一课就是炮火压制的使用，郑芝龙对此印象良深，再加上开始的时候，两排炮就轰灭了二百多的荷兰士兵，使他对大炮更是情有独钟了。
他立即命令集中二十三门新式大炮和四十多门射程远的老式火炮，准备对乌特利支堡展开一场史无前例的炮击，要把以前纯粹利用人海战术攻城掠地的方式改一改。
大炮调试好后，十三日下午，未时三刻，汉军近七十门大炮黑洞洞的炮口对准了乌特利支堡。随着指挥官一声令下，“轰隆隆”的炮声响彻午后的天空。无数炮弹划过天空，飞向倒霉的乌特利支堡。坚固的乌特利支堡在汉军炮火的蹂躏下无助的呻吟着，恍若惊涛骇浪中的一叶扁舟。
七百多炮弹倾泻过后，汉军炮兵开始暂歇。笼罩住乌特利支堡的硝烟渐渐的散尽了，开火前还算整齐壮观的乌特利支堡现在却变的与废墟没有什么区别，到处一片狼藉，凄惨非常。
当汉军的第二轮炮击正准备开始的时候，一支枪挑着一件带血的白衬衫缓缓的从城堡的废墟中伸了出来，同时传来生硬的中国话：“投降！”
处理完从乌特利支堡俘虏来的一百多荷兰士兵后，汉军的目标又对准了台湾城。
对乌特利支堡的炮击过程被台湾城的荷兰士兵们全程“欣赏”了，台湾城里一片世界末日就要来临的气氛，没办法，出击的两百多弟兄让人家两排炮给轰的不见影了，海军舰队全军覆没了，拱卫台湾的乌特利支堡又被炸成了废墟，不由得你不害怕。最乐观的荷兰人也绝望了，他们不知道自己还能不能看到明天的太阳。
先胜一场的汉军并没有乘胜追击，而是开始修筑工事，暂停了攻击。双方就这样对峙着，荷兰人根本不敢放枪挑衅，而汉军也全当台湾城不存在，根本没有进攻的意图。
华灯初上，荷兰的台湾总督大人John van der Burg在自己的房间里焦躁的来回踱步。对眼下的局势，他是一筹莫展：海军没了，乌特利支堡没了，赤嵌被包围了。台湾原有荷兰陆军两千三百多人，其中乌特利支堡有二百七十人，赤嵌有三百四十多人，其余近一千八百人都在台湾城里，除去被轰飞了的那二百多人，也就剩下了一千五百左右的士兵。自己这一千来人困守孤城，究竟还能坚持多久呢？现在可真是叫天天不应，叫地地不灵了。
“该死的中国土著！”John van der Burg不禁咒骂着，“他们从哪里搞来威力这么大的大炮，竟然比我们的大炮还厉害！大炮……大炮！”
他猛地想出了一个办法，立即命令：“来人，把汤马斯少校给我叫来！”